树鼩CD127全长编码序列的克隆及分子特征分析 | |
其他题名 | Cloning of the full-length coding sequence of tree shrew CD127 and prediction of its molecular charac- teristics |
田巍威1; 高跃东2; 李作生4; 张华堂*3; 郭彦3; 黄京飞2; 肖昌1; zhenght@mail.kiz.ac.cn | |
2012 | |
发表期刊 | 国际免疫学杂志
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卷号 | 35期号:4页码:293-298 |
合作性质 | 其它 |
其他摘要 | 目的树鼩可作为多种人类疾病研究的良好模型,但其免疫系统各类细胞表面标志、功能以及在疾病发生、发展过程中的作用和意义尚无系统研究。研究以获得树购调节性T细胞(Tr)相关分子CD127为目的,以分析其分子特征。方法提取树胸外周血总RNA反转录,经巢式PCR扩增获得目的片段,进而以DiscoveryStudio等生物软件进行分析。结果扩增得到全长为1392bp的树鼩CD127编码序列,确定了现有数据库中缺失的一处未知片段。树鼩CD127与人、黑猩猩亲缘关系较近,其氨基酸序列具有较高保守性,蛋白质三维结构整体与人相似,但N糖基化位点数目以及电荷分布存在差异。结论所得序列能够编码具有正常功能的蛋白,全长序列为后续单克隆抗体制备奠定了基础,有助于鉴定树鼩Treg细胞以及相关疾病机理的研究。; Objective Tree shrews is a good human diseases models. The cloning of its immune cellular markers is necessary. This study is to obtain Tree shrews CD127 for analyzing its molecular characteristics. Methods The CD127 gene was amplified from total RNA of tree shrews peripheral blood by RT-nested PCR and its biological characteristics were analyzed by biology software such as Discovery Studio. Results The full- length CD127 cDNA encoding 1392bp of Tree shrews was cloned and one unknown fragment of tree shrews CD127 cDNA in the database was defined. Tree shrews CD127 amino acid sequence was conserved, and showed a close genetic relationship with Homo sapiens and Pan troglodytes. The structure of Tree shrews CD127 showed a similarity with human CD127, but some differences in the N-glyasylation sites number and the charge dist.ribution have been detected. Conclusions The fulllength sequence obtained in this study encodes Tree shrews CD127 which would function as its counterpart of the primate. It is useful for the preparation of antibody and studies of the role of Tree shrews Tr in human diseases. |
关键词 | 树鼩 Cd127 Rt-巢式pcr 结构 单克隆抗体 |
资助者 | 国家重点基础研究发展计划(973计划)分课题(2007CB512807);中国科学院知识创新工程重要方向项目(KSCX2-EW-R-12;KSCX2-EW-R-13);中国科学院基础前沿研究专项项目(KSCX2-EW-J-23);中科院昆明动物研究所“动物模型与人类疾病机理重点实验室”开放课题 ; 国家重点基础研究发展计划(973计划)分课题(2007CB512807);中国科学院知识创新工程重要方向项目(KSCX2-EW-R-12;KSCX2-EW-R-13);中国科学院基础前沿研究专项项目(KSCX2-EW-J-23);中科院昆明动物研究所“动物模型与人类疾病机理重点实验室”开放课题 ; 国家重点基础研究发展计划(973计划)分课题(2007CB512807);中国科学院知识创新工程重要方向项目(KSCX2-EW-R-12;KSCX2-EW-R-13);中国科学院基础前沿研究专项项目(KSCX2-EW-J-23);中科院昆明动物研究所“动物模型与人类疾病机理重点实验室”开放课题 ; 国家重点基础研究发展计划(973计划)分课题(2007CB512807);中国科学院知识创新工程重要方向项目(KSCX2-EW-R-12;KSCX2-EW-R-13);中国科学院基础前沿研究专项项目(KSCX2-EW-J-23);中科院昆明动物研究所“动物模型与人类疾病机理重点实验室”开放课题 ; 国家重点基础研究发展计划(973计划)分课题(2007CB512807);中国科学院知识创新工程重要方向项目(KSCX2-EW-R-12;KSCX2-EW-R-13);中国科学院基础前沿研究专项项目(KSCX2-EW-J-23);中科院昆明动物研究所“动物模型与人类疾病机理重点实验室”开放课题 ; 国家重点基础研究发展计划(973计划)分课题(2007CB512807);中国科学院知识创新工程重要方向项目(KSCX2-EW-R-12;KSCX2-EW-R-13);中国科学院基础前沿研究专项项目(KSCX2-EW-J-23);中科院昆明动物研究所“动物模型与人类疾病机理重点实验室”开放课题 ; 国家重点基础研究发展计划(973计划)分课题(2007CB512807);中国科学院知识创新工程重要方向项目(KSCX2-EW-R-12;KSCX2-EW-R-13);中国科学院基础前沿研究专项项目(KSCX2-EW-J-23);中科院昆明动物研究所“动物模型与人类疾病机理重点实验室”开放课题 ; 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国家重点基础研究发展计划(973计划)分课题(2007CB512807);中国科学院知识创新工程重要方向项目(KSCX2-EW-R-12;KSCX2-EW-R-13);中国科学院基础前沿研究专项项目(KSCX2-EW-J-23);中科院昆明动物研究所“动物模型与人类疾病机理重点实验室”开放课题 |
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文献类型 | 期刊论文 |
条目标识符 | http://ir.kiz.ac.cn/handle/152453/10258 |
专题 | 分子免疫生物学 科研部门_动物模型与人类重大疾病机理重点实验室 遗传资源与进化国家重点实验室 结构生物信息学 管理、支撑部门_大型仪器中心 |
通讯作者 | zhenght@mail.kiz.ac.cn |
作者单位 | 1.西南大学生物技术学院,重庆400715 2.中国科学院昆明生物多样性大型仪器区域中心;中国科学院昆明动物研究所遗传资源与进化国家重点实验室,650223 3.中国科学院昆明动物研究所动物模型与人类疾病机理重点实验室;免疫生物学实验室,650223 4.成都军区疾病预防控制中心,昆明650223 |
推荐引用方式 GB/T 7714 | 田巍威,高跃东,李作生,等. 树鼩CD127全长编码序列的克隆及分子特征分析[J]. 国际免疫学杂志,2012,35(4):293-298. |
APA | 田巍威.,高跃东.,李作生.,张华堂*.,郭彦.,...&zhenght@mail.kiz.ac.cn.(2012).树鼩CD127全长编码序列的克隆及分子特征分析.国际免疫学杂志,35(4),293-298. |
MLA | 田巍威,et al."树鼩CD127全长编码序列的克隆及分子特征分析".国际免疫学杂志 35.4(2012):293-298. |
条目包含的文件 | ||||||
文件名称/大小 | 文献类型 | 版本类型 | 开放类型 | 使用许可 | ||
2016070709.pdf(385KB) | 期刊论文 | 出版稿 | 开放获取 | CC BY-NC-SA | 请求全文 |
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