猪STCH 基因的Bi2PASA 遗传标记及多态性研究

	猪STCH 基因的Bi2PASA 遗传标记及多态性研究
其他题名	Bi2PASA Genetic Marker and Polymorphism of the Porcine STCH Gene
	史宪伟[*]1; 魏麟 1; 韩洪金 2; xwshi5@yahoo.com
	2005
发表期刊	动物学研究
卷号	26 期号:1 页码:76 - 81
合作性质	其它
摘要	微粒体应激 70蛋白三磷酸腺苷酶 (STCH)基因属于应激 70蛋白基因伴侣家族 ,在机体免疫反应和疾病抵抗力等方面起重要作用。根据人和小鼠STCH基因的保守序列设计引物 ,PCR扩增到猪STCH基因第5外显子 4 4 5bp片段。序列测定显示 ,猪STCH基因与人和小鼠STCH基因分别具有 87 13%和 80 4 5 %的同源性。通过测定和比较中国梅山猪、欧洲约克夏猪及PIC商品猪的STCH基因序列 ,发现在猪STCH基因编码区第 5外显子 10 5 0位点上存在一个单碱基突变位点。利用双向特定等位基因PCR扩增法 (Bi PASA)建立了检测猪STCH基因变异的遗传标记 ,并用该标记分析了STCH基因在中国家猪 (梅山猪、荣昌猪和金华猪 )、欧洲家猪 (约克夏猪、大白猪 )、商品猪 (PIC合成系 )以及欧洲野猪的基因频率和多态性。本研究建立的Bi PASA遗传标记和基因变异信息 ,将为进一步分析猪STCH基因变异与经济性状的相关分析提供基础资料。
其他摘要	Microsomal stress 70 protein ATPase core ( STCH ) is a member of the stress 70 protein chaperone family and plays a major role in the immune response and disease resistance of host. Based on the conserved regions of STCH gene sequences from human and mouse , a pair of primers was designed for PCR amplification of porcine STCH gene. A fragment of 445 base pairs product in the exon 5 of pig STCH gene was successfully amplified with the primers. The porcine STCH sequence determined from this fragment showed 87 1 13 % and 80 1 45 % nucleotide identity to the corre 2 sponding human and mouse STCH sequences , respectively. A single nucleotide polymorphism (SNP) was found at the position 1 050 of coding sequence in the exon 5 of porcine STCH gene according to the sequencing and alignment of STCH genes from Meishan pigs , Yorkshire pigs and PIC commercial pigs. As no cutting sites of all known restriction enzymes could be found for the SNP , Bi 2 directional PCR amplification of specific alleles (Bi 2 PASA) was employed to detect the mutation. According to the porcine STCH Bi 2 PASA marker , the gene allele frequencies and gene polymorphisms were an 2 alyzed in the Chinese pig populations (Meishan pigs , Rongchang pigs , Jinhua pigs) and European populations (York 2 shire pigs , Large white pigs) as well as a commercial line (PIC pigs) . The STCH Bi 2 PASA marker established in this study and polymorphic information obtained from population analysis may be helpful for the further association study be 2 tween the pig STCH gene mutations and economic traits in pigs.
关键词	猪 Stch Bi2pasa 多态性遗传标记
资助者	国家自然科学基金资助项目(30270072) ; 云南省自然科学基金资助项目(2000C0078M , 2002C0064M) ; 国家自然科学基金资助项目(30270072) ; 云南省自然科学基金资助项目(2000C0078M , 2002C0064M) ; 国家自然科学基金资助项目(30270072) ; 云南省自然科学基金资助项目(2000C0078M , 2002C0064M) ; 国家自然科学基金资助项目(30270072) ; 云南省自然科学基金资助项目(2000C0078M , 2002C0064M)
收录类别	其他
语种	中文
资助者	国家自然科学基金资助项目(30270072) ; 云南省自然科学基金资助项目(2000C0078M , 2002C0064M) ; 国家自然科学基金资助项目(30270072) ; 云南省自然科学基金资助项目(2000C0078M , 2002C0064M) ; 国家自然科学基金资助项目(30270072) ; 云南省自然科学基金资助项目(2000C0078M , 2002C0064M) ; 国家自然科学基金资助项目(30270072) ; 云南省自然科学基金资助项目(2000C0078M , 2002C0064M)
文献类型	期刊论文
条目标识符	http://ir.kiz.ac.cn/handle/152453/1224
专题	科研部门_分子进化与基因组多样性（张亚平）
通讯作者	xwshi5@yahoo.com
作者单位	1.云南农业大学动物科学技术学院,云南省生物多样性与生物技术人才培养基地,云南昆明650201 2.中国科学院昆明动物研究所,云南省畜禽分子生物学重点实验室,昆明650223
推荐引用方式 GB/T 7714	史宪伟[*],魏麟,韩洪金,等. 猪STCH 基因的Bi2PASA 遗传标记及多态性研究[J]. 动物学研究,2005,26(1):76 - 81.
APA	史宪伟[*],魏麟,韩洪金,&xwshi5@yahoo.com.(2005).猪STCH 基因的Bi2PASA 遗传标记及多态性研究.动物学研究,26(1),76 - 81.
MLA	史宪伟[*],et al."猪STCH 基因的Bi2PASA 遗传标记及多态性研究".动物学研究 26.1(2005):76 - 81.

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200526176.pdf（291KB）	期刊论文	出版稿	开放获取	CC BY-NC-SA	请求全文