采用诱导环化酶制备Illumina Mate-paired DNA文库

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	采用诱导环化酶制备Illumina Mate-paired DNA文库
	何雨琦; 李桂梅; 周鑫; 李晓璐; 高跃东; 丁昭莉
	2019
发表期刊	基因组学与应用生物学
ISSN	1674-568X
卷号	38 期号:7 页码:2990-2995
摘要	新一代测序技术(NGS)的文库制备方法在基因组的拼装中起着重要作用。但是NGS技术制备的普通DNA文库片段只有500 bp左右,难以满足复杂基因组的从头(de novo)拼装要求。三代测序技术的读长可以达到20 kb,但是其高错误率及测序成本过高使得其又不易推广。因此二代测序的Mate-paired文库制备技术一直在基因组的de novo拼装中扮演着非常重要的角色。目前主流的NGS平台Illumina制备的Mate-paired文库的片段范围只有2~5 kb,为了得到更长的可用于Illumina平台测序的Mate-paired文库,本研究首次整合并优化了Illumina和Roche/454两种测序平台的Mate-paired文库制备技术,采用诱导环化酶来提高基因组长片段DNA的环化效率,成功建立了20 kb Mate-paired文库制备技术,并已将该技术应用于人类基因组20 kb Mate-paired文库制备。该技术为Illumina平台制备长片段Mate-paired库提供了方法指导。
收录类别	CSCD
语种	中文
引用统计
文献类型	期刊论文
条目标识符	http://ir.kiz.ac.cn/handle/152453/13931
专题	管理、支撑部门_大型仪器中心
推荐引用方式 GB/T 7714	何雨琦,李桂梅,周鑫,等. 采用诱导环化酶制备Illumina Mate-paired DNA文库[J]. 基因组学与应用生物学,2019,38(7):2990-2995.
APA	何雨琦,李桂梅,周鑫,李晓璐,高跃东,&丁昭莉.(2019).采用诱导环化酶制备Illumina Mate-paired DNA文库.基因组学与应用生物学,38(7),2990-2995.
MLA	何雨琦,et al."采用诱导环化酶制备Illumina Mate-paired DNA文库".基因组学与应用生物学 38.7(2019):2990-2995.

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文件名称/大小	文献类型	版本类型	开放类型	使用许可
2023032901.pdf（1187KB）	期刊论文	出版稿	开放获取	CC BY-NC-SA	请求全文