KMS KUNMING INSTITUTE OF ZOOLOGY.CAS
| 生物分子水溶液的Monte Carlo模拟 Ⅲ: 力偏倚抽样法和Metropolis抽样法的比较 | |
| 石秀凡1; 倪向善2; 凌伦奖2 | |
| 1989 | |
| 发表期刊 | 生物物理学报
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| ISSN | 1000-6737 |
| 卷号 | 5期号:3页码:246-251 |
| 合作性质 | 其它 |
| 摘要 | 本文采用先前所用的一个中性丙氨酸分子加56个水分子的体系,对力偏倚(FB)抽样法和Metropolis抽样法进行了比较.发现用FB法,由体系的晶体点阵构型出发到达平衡态所需的循环数为Metropolis法的五分之二.为了得到较好的结构信息所需的构型数也仅为后者的五分之二.虽然每个循环所需机时为Metropolis法的1.6倍,仍是一加速收敛的好方法.本文进一步支持了以分子的平移扩散作为判别抽样效率的判据,指出接受几率在0.33——0.36之间的步长可能是合适的.此外还统计了和丙氨酸作用大于2keal/mol的分子的坚标,使它们与丙氨酸—水分子径向分布图的峰值相对应. |
| 关键词 | 抽样法 平移扩散 生物分子 抽样效率 平衡态 |
| 资助者 | 家自然科学基金资助项目 ; 家自然科学基金资助项目 |
| URL | 查看原文 |
| 收录类别 | 其他 |
| 语种 | 中文 |
| 资助者 | 家自然科学基金资助项目 ; 家自然科学基金资助项目 |
| 文献类型 | 期刊论文 |
| 条目标识符 | http://ir.kiz.ac.cn/handle/152453/2933 |
| 专题 | 其他 |
| 作者单位 | 1.中国科学院昆明动物研究所 2.中国科学院生物物理研究所 |
| 推荐引用方式 GB/T 7714 | 石秀凡,倪向善,凌伦奖. 生物分子水溶液的Monte Carlo模拟 Ⅲ: 力偏倚抽样法和Metropolis抽样法的比较[J]. 生物物理学报,1989,5(3):246-251. |
| APA | 石秀凡,倪向善,&凌伦奖.(1989).生物分子水溶液的Monte Carlo模拟 Ⅲ: 力偏倚抽样法和Metropolis抽样法的比较.生物物理学报,5(3),246-251. |
| MLA | 石秀凡,et al."生物分子水溶液的Monte Carlo模拟 Ⅲ: 力偏倚抽样法和Metropolis抽样法的比较".生物物理学报 5.3(1989):246-251. |
| 条目包含的文件 | ||||||
| 文件名称/大小 | 文献类型 | 版本类型 | 开放类型 | 使用许可 | ||
| 198953246.pdf(1640KB) | 期刊论文 | 出版稿 | 开放获取 | CC BY-NC-SA | 请求全文 | |
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