抑制启动子的三链DNA的结构模建及稳定性研究

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	抑制启动子的三链DNA的结构模建及稳定性研究
其他题名	Stability and molecular modeling of triplex DNA inhibiting DNA binding protein binding to the core promoter of hepatitis B virus
	杨洁; 刘次全*; tbrg@public.km.yn.cn
	2000
发表期刊	生物化学与生物物理进展
ISSN	1000-3282
卷号	27 期号:3 页码:283-286
摘要	在IRIS Indigo2(SGI公司)工作站上,利用InsightⅡ/MSI软件包,以TAT三链DNA为模板,采用同源模建的方法,分别建立起两个含21nt的脱氧寡核苷酸CP1(G3TG2TGT2G5TG2TGT)和CP3(TGTG2TG5T2GTG2TG3)的三维结构。采用分子力学方法进行能量优化,将得到的能量最低结构作为分子的优势构象。研究结果显示,CP1的能量低于CP3的能量,即前者的结构较后者稳定。
其他摘要	Two three-dimensional structure models of the 21nt oligodeoxyribonucleotides, CPI (G3TG-2TGT2G5TG2TGT) and CP3 (TGTG2TGST2GTG2TG3), were constructed by InsightII (MSI) software in IRIS Indigo2 (SGI) workstation using the crystal structure of TAT tripler formation as the template. The initial structures subsequently were minimized by molecular mechanics. The final structures were believed as the dominant conformation. The results showed that the energy of CP1 is lower than that of CP3, and the former is more stable than the latter. Moreover, the results further proved that the 21nt oligodeoxyribo-nucleotide CP1 stably combines with the core promoter (Cp) fragment of hepatitis B virus (HBV) to form a tripler DNA, and CP1 specifically inhibits a specific cellular factor (DNA binding protein) binding to Cp fragment. These results indicated that specific repression of gene transcription of HBV DNA might be possible by tripler-formation DNA.
关键词	三链dna 反基因策略同源模建核心启动子乙肝病毒 (Hbv)
资助者	国家自然科学基金资助项目(39770418) ; 国家自然科学基金资助项目(39770418) ; 国家自然科学基金资助项目(39770418) ; 国家自然科学基金资助项目(39770418)
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收录类别	其他
语种	中文
资助者	国家自然科学基金资助项目(39770418) ; 国家自然科学基金资助项目(39770418) ; 国家自然科学基金资助项目(39770418) ; 国家自然科学基金资助项目(39770418)
文献类型	期刊论文
条目标识符	http://ir.kiz.ac.cn/handle/152453/3749
专题	其他
通讯作者	tbrg@public.km.yn.cn
作者单位	中国科学院昆明动物研究所,昆明650223
推荐引用方式 GB/T 7714	杨洁,刘次全*,tbrg@public.km.yn.cn. 抑制启动子的三链DNA的结构模建及稳定性研究[J]. 生物化学与生物物理进展,2000,27(3):283-286.
APA	杨洁,刘次全*,&tbrg@public.km.yn.cn.(2000).抑制启动子的三链DNA的结构模建及稳定性研究.生物化学与生物物理进展,27(3),283-286.
MLA	杨洁,et al."抑制启动子的三链DNA的结构模建及稳定性研究".生物化学与生物物理进展 27.3(2000):283-286.

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