Yeast基因下游二级结构与多聚腺苷作用信号

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	Yeast基因下游二级结构与多聚腺苷作用信号
其他题名	Secondary structure of yeast genomic downstream region and polyadenylation signals
	张静*1; 石秀凡 3; 刘次全 2,3; jzhang213@263.net
	2001
发表期刊	生物化学与生物物理进展
ISSN	1000-3282
卷号	28 期号:4 页码:523-527
合作性质	其它
摘要	形成真核生物mRNA 3′末端的多聚腺苷（poly(A)）作用涉及前体mRNA下游的三个元件：效率元件（EE）、定位元件（PE）以及实际的剪切和poly(A)作用位点，实验研究提出了一些EE和PE的碱基序列组成.对180个Yeast基因下游（终止密码子后200个碱基）二级结构进行的详细分析显示，约86%的EE、89%的PE与二级结构中碱基非配对的环(发夹环、膨胀环、内环或多分支环)区或连接单链区有关.这个结果提示，反式因子对EE和PE的识别和作用在一定程度上有赖于EE和PE的二级结构特征.借助mRNA二级结构可以提高对EE和PE位点预测的准确性.
其他摘要	Polyadenylation of 3 ' -forming in eukaryote concerns three elements located in precursor mRNA downstream region: efficiency element (EE), position element (PE) and the actual site for cleavage and polyadenylation. Several base sequences of EE and PE have been proposed by many experiments. The secondary structures of 180 yeast genomic downstream regions (200 bases downstream the stop codon), have been analysed in detail. It is showed that about 86 % of EE sites and 89 % of PE sites are related to the regions of non-paired loop (hairpin loop, bulge loop, interior loop or multi-branched loop) or to connecting single strand. This result suggests that the identifications and actions of EE and PE by trans-factors, to certain extent, are dependent on the structural features of EE and PE in the secondary structure. According to the secondary structure of mRNA, the prediction accuracy of EE and PE sites may be improved.
关键词	Yeast 多聚腺苷作用信号 Mrna二级结构
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收录类别	其他
语种	中文
文献类型	期刊论文
条目标识符	http://ir.kiz.ac.cn/handle/152453/3763
专题	其他
通讯作者	jzhang213@263.net
作者单位	1.云南大学应用统计中心,昆明650091 2.云南大学现代生物中心,昆明650091 3.中国科学院昆明动物研究所,昆明650223
推荐引用方式 GB/T 7714	张静*,石秀凡,刘次全,等. Yeast基因下游二级结构与多聚腺苷作用信号[J]. 生物化学与生物物理进展,2001,28(4):523-527.
APA	张静*,石秀凡,刘次全,&jzhang213@263.net.(2001).Yeast基因下游二级结构与多聚腺苷作用信号.生物化学与生物物理进展,28(4),523-527.
MLA	张静*,et al."Yeast基因下游二级结构与多聚腺苷作用信号".生物化学与生物物理进展 28.4(2001):523-527.

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2001284523.pdf（215KB）	期刊论文	出版稿	开放获取	CC BY-NC-SA	请求全文