大肠杆菌基因中密码子前后碱基的使用与蛋白质结构

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	大肠杆菌基因中密码子前后碱基的使用与蛋白质结构
其他题名	RELATIONSHIP BETWEEN THE CONTEXT BASE USAGE OF CONDONS AND PROTEIN STRUCTURE IN ESCHERICHIA COL I GENES
	张静 1; 顾宝洪 2; 石秀凡 4; 刘次全 3,4; jzhang213@263.net
	2001
发表期刊	生物物理学报
ISSN	1000-6737
卷号	17 期号:1 页码:174-180
摘要	对一组E.coli基因中编码蛋白质各类二级结构 (α -螺旋、β-折叠片、无规卷曲和回折 )的密码子前后碱基的使用情况进行统计分析和比较 ,发现一些密码子前后碱基的使用有偏向 ,而且这些偏向与蛋白质的二级结构有关联。这同时亦表明 ,E.coli基因中同义密码子的选用与蛋白质的二级结构有一些关联。模型对于蛋白质结构预测算法的改进以及基因工程的研究有辅助作用。
其他摘要	The context base usages of codons encoding for different secondary structures ( α - helix , β - sheet , coil and turn) of protein in a set of Escherichia coli genes were statistically analysed and compared. It is concluded that the context base usages of several codons are biased and the biases seem to be related to the secondary structures of protein. This result also shows that there are some correlations between the choice of synonymous codons and the secondary structures of protein in E. coli genes. The model in this paper may be useful for predicting algorithms of secondary structure of protein and gene engineering researching.
部门归属	其他
关键词	蛋白质二级结构 Mrna 密码子前后碱基使用偏向同义密码子
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收录类别	其他
语种	中文
文献类型	期刊论文
条目标识符	http://ir.kiz.ac.cn/handle/152453/3771
专题	其他细胞与分子进化开放实验室
通讯作者	jzhang213@263.net
作者单位	1.云南大学应用统计中心 2.云南大学物理系 3.云南大学现代生物中心,云南昆明650091 4.中国科学院昆明动物研究所细胞与分子进化开放实验室 ,云南昆明650223
推荐引用方式 GB/T 7714	张静,顾宝洪,石秀凡,等. 大肠杆菌基因中密码子前后碱基的使用与蛋白质结构[J]. 生物物理学报,2001,17(1):174-180.
APA	张静,顾宝洪,石秀凡,刘次全,&jzhang213@263.net.(2001).大肠杆菌基因中密码子前后碱基的使用与蛋白质结构.生物物理学报,17(1),174-180.
MLA	张静,et al."大肠杆菌基因中密码子前后碱基的使用与蛋白质结构".生物物理学报 17.1(2001):174-180.

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2001171174.pdf（214KB）	期刊论文	出版稿	开放获取	CC BY-NC-SA	请求全文