KMS KUNMING INSTITUTE OF ZOOLOGY.CAS
| 翻译速率与蛋白质二级结构的关系 | |
| 其他题名 | The relation between translation speed and protein secondary structure |
| 李晓琴1,2; 罗辽复*1,2; 刘次全*2; lfluo@mail.imu.edu.cn | |
| 2003 | |
| 发表期刊 | 生物化学与生物物理学报
 |
| ISSN | 0582-9879 |
| 卷号 | 35期号:2页码:193-196 |
| 合作性质 | 其它 |
| 摘要 | 统计分析了人的 119 种蛋白质和大肠杆菌的 92 种蛋白质密码子翻译速率和蛋白质二级结构的关系。据m 2密码子片段在不同二级结构中的频数分布 , 我们发现人和大肠杆菌中翻译速率与蛋白质二级结构之间有一定关系 : 高翻译速率时倾向编码α螺旋、不倾向编码线团 (coil) ; 低翻译速率时倾向编码线团、不倾向编码α螺旋 ; β 折叠结构则随翻译速率表现出明显的振荡。同时 , 密码子的使用在不同片段内一般也是不均匀的 : 在α螺旋片段内 , 结构尾部偏向使用高翻译速率密码子 ; 中部倾向使用中翻译速率密码子 ; 而头部使用的密码子翻译速率偏低。这样的倾向性不大可能归结为随机起伏的影响。 |
| 其他摘要 | Based on the statistical analysis of 119 human and 92 E. coli proteins it was found that for both human and E. coli, the mRNA sequences consisting of tri-codon and tetra-codon with high translation speed preferably code for alpha helices more than for coils. For beta strand, the preference/avoidance oscillates with the translation speed. Moreover, the non-homogeneous usages of tri-codon and tetra-codon with different translation speeds in a given secondary structure have also been found. These results cannot be simply explained by the effect of stochastic fluctuation. |
| 关键词 | m Rna序列 蛋白质二级结构 翻译速率 |
| 资助者 | 国家自然科学基金重大项目 (No. 90103030) 和昆明动物所细胞 与分子进化开放实验室课题基金资助。 ; 国家自然科学基金重大项目 (No. 90103030) 和昆明动物所细胞 与分子进化开放实验室课题基金资助。 ; 国家自然科学基金重大项目 (No. 90103030) 和昆明动物所细胞 与分子进化开放实验室课题基金资助。 ; 国家自然科学基金重大项目 (No. 90103030) 和昆明动物所细胞 与分子进化开放实验室课题基金资助。 |
| URL | 查看原文 |
| 收录类别 | 其他 |
| 语种 | 中文 |
| 资助者 | 国家自然科学基金重大项目 (No. 90103030) 和昆明动物所细胞 与分子进化开放实验室课题基金资助。 ; 国家自然科学基金重大项目 (No. 90103030) 和昆明动物所细胞 与分子进化开放实验室课题基金资助。 ; 国家自然科学基金重大项目 (No. 90103030) 和昆明动物所细胞 与分子进化开放实验室课题基金资助。 ; 国家自然科学基金重大项目 (No. 90103030) 和昆明动物所细胞 与分子进化开放实验室课题基金资助。 |
| 文献类型 | 期刊论文 |
| 条目标识符 | http://ir.kiz.ac.cn/handle/152453/3981 |
| 专题 | 其他 |
| 通讯作者 | lfluo@mail.imu.edu.cn |
| 作者单位 | 1.中国科学院昆明动物所 , 昆明 650223 2.内蒙古大学物理系 , 呼和浩特 010021 |
| 推荐引用方式 GB/T 7714 | 李晓琴,罗辽复*,刘次全*,等. 翻译速率与蛋白质二级结构的关系[J]. 生物化学与生物物理学报,2003,35(2):193-196. |
| APA | 李晓琴,罗辽复*,刘次全*,&lfluo@mail.imu.edu.cn.(2003).翻译速率与蛋白质二级结构的关系.生物化学与生物物理学报,35(2),193-196. |
| MLA | 李晓琴,et al."翻译速率与蛋白质二级结构的关系".生物化学与生物物理学报 35.2(2003):193-196. |
| 条目包含的文件 | ||||||
| 文件名称/大小 | 文献类型 | 版本类型 | 开放类型 | 使用许可 | ||
| 2003352193.pdf（150KB） | 期刊论文 | 出版稿 | 开放获取 | CC BY-NC-SA | 请求全文 | |
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