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转座子Minos介导的果蝇转基因平台构建及水稻高表达启动子的克隆
其他题名The establishment of fruit fly transgenic platform using Minos transposon The clone of rice high expression promoters
任娟
学位类型硕士
导师王文
2010
学位授予单位中国科学院研究生院
学位授予地点北京
关键词Minos转座子 显微注射 热激 D. Melanogaster D. Yakuba 水稻启动子 愈伤组织 转染 Gus染色
摘要本实验室果蝇研究工作,主要集中在黑腹果蝇的新基因起源的研究。新基因起源的分子机制主要包括:外显子重排、基因复制、基因逆转座、移动元件介导、基因水平转移、基因从头起源、基因的断裂融合。为了阐述这些新基因的产生和它们所带来的物种适应性,我们对这些新近起源的基因进行了功能研究。但是,仅仅限于新基因所在物种的功能研究并不能完全解释新基因产生的进化原因,我们需要了解它是否能够给没有该基因的果蝇物种带来一定的适应性。例如一些生殖相关新基因,如果我们将它们转入没有该基因的果蝇,那是否能够给该果蝇带来生殖能力的提高?无论结果如何,这都为我们研究新基因的起源提供一个重要线索。由此,黑腹果蝇以外的其它果蝇物种中实现转基因成为该研究的重要技术环节。但是,实验室目前的转基因系统仅限于P转座子介导的黑腹果蝇转基因系统,因而我们需要建立一种新的转基因平台。而转座子Minos打破物种范围的转基因特性,以及它的转座特点为我们提供了选择。转座子Minos是从果蝇D. hydei中克隆出来长约1.8kb的Ⅱ型转座子,Tc1家族转座元件成员。Minos的转座机制与大部分转座子一样,在宿主基因组里面实行着剪切和粘贴的运作机制。Minos在转座时,偏向插入TA位点并且主要集中于内含子区域,这样可以减少对插入位置基因的影响。此外,Minos在黑腹果蝇中的转座效率约30%,并且拥有一套成熟的选择标记。因此,Minos成为我们解决非黑腹果蝇转基因技术难题的首选。 在本文的工作中,我们采用由希腊Savakis教授(希腊分子生物学与生物技术研究所)提供的Minos转基因系统,完成果蝇的转基因实验。在这套转基因系统中,非自主的转座子Minos和转座酶基因被克隆到了不同载体当中。其中Minos转座子序列中插入了由3xP3眼睛特异表达的启动子介导表达的eGFP报告基因,而转座酶基因则由热激蛋白hsp70启动子调控表达。实验过程中,我们在果蝇D. melanogaster 和D. yakuba的胚胎中分别同时显微注射入含有转座子和转座酶本实验室果蝇研究工作,主要集中在黑腹果蝇的新基因起源的研究。新基因起源的分子机制主要包括:外显子重排、基因复制、基因逆转座、移动元件介导、基因水平转移、基因从头起源、基因的断裂融合。为了阐述这些新基因的产生和它们所带来的物种适应性,我们对这些新近起源的基因进行了功能研究。但是,仅仅限于新基因所在物种的功能研究并不能完全解释新基因产生的进化原因,我们需要了解它是否能够给没有该基因的果蝇物种带来一定的适应性。例如一些生殖相关新基因,如果我们将它们转入没有该基因的果蝇,那是否能够给该果蝇带来生殖能力的提高?无论结果如何,这都为我们研究新基因的起源提供一个重要线索。由此,黑腹果蝇以外的其它果蝇物种中实现转基因成为该研究的重要技术环节。但是,实验室目前的转基因系统仅限于P转座子介导的黑腹果蝇转基因系统,因而我们需要建立一种新的转基因平台。而转座子Minos打破物种范围的转基因特性,以及它的转座特点为我们提供了选择。转座子Minos是从果蝇D. hydei中克隆出来长约1.8kb的Ⅱ型转座子,Tc1家族转座元件成员。Minos的转座机制与大部分转座子一样,在宿主基因组里面实行着剪切和粘贴的运作机制。Minos在转座时,偏向插入TA位点并且主要集中于内含子区域,这样可以减少对插入位置基因的影响。此外,Minos在黑腹果蝇中的转座效率约30%,并且拥有一套成熟的选择标记。因此,Minos成为我们解决非黑腹果蝇转基因技术难题的首选。 在本文的工作中,我们采用由希腊Savakis教授(希腊分子生物学与生物技术研究所)提供的Minos转基因系统,完成果蝇的转基因实验。在这套转基因系统中,非自主的转座子Minos和转座酶基因被克隆到了不同载体当中。其中Minos转座子序列中插入了由3xP3眼睛特异表达的启动子介导表达的eGFP报告基因,而转座酶基因则由热激蛋白hsp70启动子调控表达。实验过程中,我们在果蝇D. melanogaster 和D. yakuba的胚胎中分别同时显微注射入含有转座子和转座酶所在的质粒。转座酶在37度条件诱导下进行表达,协助Minos完成转座过程。在转基因果蝇的阳性筛选中,我们利用眼睛特异表达的绿色荧光蛋作为选择标记。并且,我们通过PCR实验进一步验证了转基因果蝇的真实性。本研究中,我们对转基因实验条件进行了初步优化。我们通过对黑腹果蝇白眼突变品系W1118和D. yakuba注射后胚胎进行保湿,对D. yakuba注射胚胎进行非退壳处理。在改进条件下W1118和D. yakuba的存活率分别为10%和3%左右。通过筛选转基因阳性果蝇,我们得出Minos在W1118和D. yakuba中的转座效率分别在32%和20%左右。我们的实验结果再一次证实了Minos在果蝇D. melanogaster中可行性。同时,该工作也初步完成了在果蝇D. yakuba 中的第一次Minos介导的转基因实验,为新基因的跨物种功能研究奠定了实验基础。在未来的工作计划中,我们将采用Minos转基因系统,把实验室目前研究的黑腹果蝇新基因导入其它物种果蝇进行功能研究。 水稻是一种重要的世界粮食作物,世界上过半的人口以水稻为主食。水稻相对别的粮食作物来讲具有较小的基因组,并且拥有较好的基因组注释,是一种理想的单子叶模式生物。植物转基因技术的发展推动着水稻功能基因组学的研究,目前水稻的转基因技术主要依赖于土壤细菌农杆菌(Agrobacterium tumefaciens)T-DNA介导的外源基因染色体插入。在自然状态下,农杆菌的T-DNA位于Ti致瘤质粒当中。它包括了一些转座元件和一些帮助T-DNA转座的毒性蛋白基因和调节基因。由于Ti质粒上的T-DNA太长,并且没有太多的酶切位点,因此自然状态的T-DNA不适合进行转基因实验。为了方便T-DNA的实际应用,研究人员创立了双载体转基因系统。T-DNA转座区被分离到出Ti载体,并且装载到另外一个适合实验操作的质粒当中,而毒性蛋白表达基因等则保留在Ti质粒上。因此,在进行T-DNA介导的转基因实验时,需要同时存在T-DNA载体和Ti质粒。 本文以“水稻注释计划数据库RAP-DB”的表达数据为参考,选择了60个高表达基因的启动子区域进行克隆。通过对T-DNA载体pCAMBIA1301 进行改造,去掉其原来的35S启动子,将预测的基因启动子克隆到该载体中并与报告基 摘要 因GUS 基因融合。通过分子克隆实验,我们得到了45个高表达基因的启动子载体。最终,为了测试这45个启动子的启动效率,我们会将它们转化到水稻愈伤组织中通过启动子融合的GUS基于表达情况来判断我们启动子的启动效率。
其他摘要Gene origination is a basic process during the species evolution. How genes originate and how new genes function and contribute to the better survival of the speecies keep attracting biologist. In order to understand the original of new genes in D. menlanogaster, it seems to be an appealing task to tranfer the new genes into other related species, such as D. yakuba. However there was no such transformation system in our lab. We only have P element transgenic system which works only in D. williston and D. melanogaster. So it is emergent to develop a new platform wich could work in other fuit fly species. We have chosen minos transposon as our tool to set up our new transgenic platform. Minos transposon element originated from Drosophila Hydei is about 1.8kb length harboring two inverted repeats and a transposase gene. The mechanism of the Minos transposition is 刢ut-past. just the same as other type II transposon. Minos works in insect species like silk worm, beetles and mosquito. Minos was widely used as a transgenic tool in insects and mammal cell lines and it could be an ideal candidate genetic tool for us to finish the transgenic works in other fruit fly species. In our experiment we used Minos transgenic system to set up our new platform in the fruit fly D. melanogaster and D . yakuba. We used a Minos vector plasmid with the enhanced green fluorescent protein (eGFP) gene as a selection marker fused with 3xP3 promoter (an eye specific expressed promoter) and a helper plasmid with the Minos transposase gene controlled by the hsp70 promoter. By microinjection of the two plasmids DNA into fruit fly embryos and 37. induced expression of transposase, the minos moved in the germ line cell of the embryos. We screened transgenic flies in the following generation by eGFP eye Abstract marker. We got flies with the eyes expressed the eGFP both in D. yakuba and D. melanogaster and confirmed them by amplification of a minos specific fragment . To our knowledge this is the first report showing that Minos succeeds in mediating the transformation of D. yakuba. And the success use of Minos in D. yakuba made us convenience to finish our further job in the D. yakuba which proceeded our investigation in the origin of new genes in D. melanogaster and the other fruit fly species. Rice (Oryza sativa L.) is one of the most important cereal species of the world, supplying more than 50% calories for the world population. It has the smallest genome in monocot plants and. It is a wonderful model organism full of genome data resources and gene mutation database. The development of plant transgenic techniques improves the rice gene function investigation. Agrobacterium tumefaciens has been routinely utilized in rice gene transfer.The T-DNA of Agrobacterium transfer DNA fragments of interest into the rice and integrate into the genome of rice. The wild type T-DNA sited in a plasmid in A. tumefaciens with other virus genes which help the transposition of T-DNA into the plant. Various efforts has been done to facilitate the rice transformation. The T-DNA separated into a new plasmid with high quality of cloning, selection, reproduction and transformation. This improvement brings a new rice transformation system 搕he binary vector system?which means both T-DNA and Ti plasmids are cooperated to finish transgenic work. Here we referred to the expression data of 揜ice Annotation Project database?and chosen several candidates high expression genes. promoter region. We clone them into the reconstructed T-DNA plasmids and obtained 45 candidate promoter vectors. We used Yundao2 (a variety of rice) to induce callus for the transformation of the promoter T-DNA vectors. We chosen GUS gene as the select marker for the efficiency of candidate promoters. By GUS staining of the transformed callus, we Abstract select promoters which were efficient and tissue specific promoted for our future use in the rice transgenic experiments.
语种中文
文献类型学位论文
条目标识符http://ir.kiz.ac.cn/handle/152453/6495
专题基因起源组
推荐引用方式
GB/T 7714
任娟. 转座子Minos介导的果蝇转基因平台构建及水稻高表达启动子的克隆[D]. 北京. 中国科学院研究生院,2010.
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