KIZ OpenIR  > 分子免疫生物学
APOBEC3G 多重转录本的发现和部分表达特征的研究
其他题名The discovery ofAPOBEC3G multiple transcripts and their expression in Vitro
孙丽
学位类型硕士
导师张华堂
2010
学位授予单位中国科学院研究生院
学位授予地点北京
关键词限制因子 Apobec3g 多重转录本 表达
摘要APOBEC3G(apolipoprotein B mRNA-editing enzyme catalytic polypeptide-like 3G,载脂蛋白B mRNA编辑酶催化多肽样蛋白3G,简称为A3G)是2002年Sheehy 发现的天然抗病毒限制因子,代表近年来病毒研究领域的一项重大进展,不仅拓 展了对病毒宿主相互作用的认识,也为研发抗病毒药提供了新的思路和方向。不 过,A3G的结构、功能和抗病毒机制仍有许多未解的重大问题,进一步深入和系 统的研究,可能为预防和治疗HIV/AIDS及多种病毒性疾病,提供新的线索。 本研究的最初线索,来源于前期工作中的偶然发现:我们试图在一个健康个 体PBMC 中克隆A3G 编码序列,经双向测序后发现,有5 个位点属非同义突变, 造成氨基酸序列的改变。为排除个体差异并出于研究的便利,我们采用单核样细 胞系THP-1,进行多条序列的克隆和分析。在研究中,我们使用错误率仅为 1.6x10-6 的高保真酶Pfu,共克隆到23 条A3G 基因编码序列。经双向测序和对比 分析,较为意外地发现,其中20 条序列具有2 个以上的非同义突变或截断错位, 突变率高达87%,显示A3G 基因在THP-1 细胞中存在多重正常或变异的转录本。 这一现象,是否代表天然突变的普遍性以及其频度和意义,有待于进一步在多种 细胞和人群多个个体中验证和大规模的系统研究。 为建立基本的实验体系和研究手段,我们通过RT-PCR 与Western blotting, 检测了A3G 基因在9 个细胞系内的本底表达水平,并在此筛选结果的基础上, 在低本底的细胞系中,以慢病毒系统表达A3G 基因,而在高本底细胞系中,通 过siRNA 沉默A3G 基因,建立了A3G 高低表达体系,为后续研究A3G 功能提 供了方便可行的实验平台。 我们选取野生型A3G、带有3 个位点(H186R、I309T、F310S)连锁的突 变体和5 个位点(W34R、Y222H、V224G、A246V、F289L)非连锁的突变体, 构建真核表达载体,转染HEK293T 细胞,对比观察不同转录本在细胞中的表达 动态和水平。结果发现,3 个位点的突变对A3G 蛋白细胞内定位无明显影响,5 个位点的突变明显增加了单个细胞中A3G 蛋白点灶状团块的比例。并且突变位 点明显减缓了A3G 的表达速率,降低了表达水平。而连锁、非连锁以及截断错 位的突变体在抗病毒功能和结构生物学上的意义,有待于进一步的深入分析。 综上,我们发现A3G 在THP-1 细胞中存在多重转录本,并在确定细胞系A3G 本底表达的基础上,建立了A3G 体外高低表达体系,为后续我们进一步研究 A3G 的功能奠定了基础。而部分突变体在细胞内的表达趋势和细胞内定位的观 察和分析,为进一步的深入研究提供了新的线索。
其他摘要The identification of human apolipoprotein B mRNA-editing enzyme catalytic polypeptide-like 3G (hA3G) represents one of the most significant advances in retrovirus research. A3G interacts with the virion infectivity factor (Vif) of HIV-1. This Vif-APOBEC3G axis now broads the scope of knowledge in host-virus regulation and forms a very attractive target for development of an entirely new class of anti-HIV drugs. Recently, a lot of progresses were made about the mechanism of their intriguing regulation within cells, the impact of these enzymes on viral evolution and disease progression, and their roles in controlling the replication of exogenous retroviruses and the structure of A3G. And, there are still much room for both function and structure research. The first clue for this project originates from an unexpected findings of the attempted cloning of wild-type A3G from human PBMCs. After sequencing, We found there are 5 Non-synonymous point-mutants in the A3G coding sequence. In order to eliminate the possibility of personal differences, We next amplified the gene from monocytic leukemia cell line, THP-1. Surprisingly, We found that the ratio of mutation is approximately 87%, by using the thermostable DNA polymerase from Pyrococcus furiosus which with the error rate of 1.6x10(-6), which undoubtedly implied that there are multiple transcripts in THP-1 cell line. Then we tested the A3G distribution and expression level in nine cell lines by using RT-PCR and Western blotting. Based on the results, we expressed the A3G gene via lentivirus system in the A3G-low-expression cell lines, and silenced the A3G gene through siRNA in the A3G-high-expression cell lines. These works have founded the research basis for A3G-HIV-1 interactions. Finally, we transfected the wild-type and the mutated clones of A3G (H186R、 I309T、F310S) and (W34R、Y222H、V224G、A246V、F289L) to HEK293T to find out the impact of mutations on A3G expression level and its dynamic characters. We concluded that the 5-point-mutant transcript can enhance the formation of High-molecular-mass A3G complexes. And both the outdated A3G could reduce the A3G expression rate when compared with the wild-type. The significance of the outdated transcripts and truncated form of A3G discovered in our project need further research. In summary, we discovered the existence of A3G multiple transcripts in THP-1. Based on the results of RT-PCR and Western blotting, we wounded the system of A3G expression in visit, established the essential basis for the analysis of A3G function. We also plan to detect the functions of the other mutated forms discovered in this project.
语种中文
文献类型学位论文
条目标识符http://ir.kiz.ac.cn/handle/152453/6516
专题分子免疫生物学
推荐引用方式
GB/T 7714
孙丽. APOBEC3G 多重转录本的发现和部分表达特征的研究[D]. 北京. 中国科学院研究生院,2010.
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