| DNA条形码技术在小型兽类物种鉴定中的探索:以甘肃莲花山为例 | |
| 其他题名 | DNA barcoding in surveys of small mammal community: a case study in Lianhuashan, Gansu Province, China |
| 何锴1; 王文智1; 李权1,2; 罗培鹏3; 孙悦华4; 蒋学龙*1; Jiangxl@mail.kiz.ac.cn | |
| 2013 | |
| 发表期刊 | 生物多样性
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| 卷号 | 21期号:2页码:197–205 |
| 合作性质 | 其它 |
| 摘要 | 为验证DNA条形码技术在小型兽类物种鉴定中的可行性,我们使用传统的形态学方法和DNA条形码技术对甘肃莲花山国家级自然保护区采集的77号小型兽类标本进行鉴定。共鉴定出物种13种,分别属于3目7科。其中小纹背鼩鼱（Sorex bedfordiae）、藏鼩鼱（S.thibetanus）、甘肃鼹（Scapanulus oweni）、黑线姬鼠（Apodemus agrarius）、社鼠（Niviventer confucianus）、斯氏鼢鼠（Eospalax smithi）、高原鼠兔（Ochotona curzoniae）等7种为莲花山首次报道。另外,采自海拔2,800m的黑线姬鼠是该物种全球海拔最高的分布记录。通过对两种方法进行比较,我们发现形态鉴定需要研究者具有足够的分类学背景,基于DNA条形码的物种鉴定则限制于网络数据库中缺乏足够的序列信息导致成功率不高。因此我们认为现阶段形态鉴定依然是小型兽类鉴定的基石和主要手段,DNA条形码技术可以作为重要的补充手段,对形态鉴定的结果进行检验。最后本文认为DNA条形码鉴定前景非常乐观,但在现阶段的使用中应与经典分类紧密结合并尽可能保存凭证标本。 |
| 其他摘要 | To evaluate the efficiency of DNA barcoding for identifying small mammals, and to enhance cur- rent understanding of mammalian diversity in the Lianhuashan Mountains, Gansu, China, standard morpho- logical and DNA barcoding approaches were used to identify 77 small mammal specimens sampled from the Lianhuashan National Nature Reserve, Gansu. Thirteen species identified were assigned to seven families in three orders, among which seven species （Sorex bedfordiae, S. thibetanus, Scapanulus oweni, Apodemus agrarius, Niviventer confucianus, Eospalax smithi and Ochotona curzoniae） are new records for the Lian- huashan Mountains. Apodemus agrarius collected at 2,800 m above sea level is the highest altitude recorded for this species. We compared the success rate and accuracy of morphological and DNA barcoding ap- proaches for identification. We found that morphological diagnosis requires well-preserved specimens and expert taxonomists, while success rate and accuracy of barcoding-based identification was limited by insuffi- cient sequences in the genetic database. We suggest that morphology should still be the foundation and prin- cipal approach used for small mammal identification. Currently, DNA barcoding might be used as a complement for checking and correcting morphological mis-diagnosis. |
| 关键词 | Dna条形码 莲花山自然保护区 小型哺乳动物 Coi基因 16s Rrna基因 |
| 资助者 | 中科院昆明动物所遗传资源与进化国家重点实验室开放课题基金(GREKF11-03). ; 中科院昆明动物所遗传资源与进化国家重点实验室开放课题基金(GREKF11-03). ; 中科院昆明动物所遗传资源与进化国家重点实验室开放课题基金(GREKF11-03). ; 中科院昆明动物所遗传资源与进化国家重点实验室开放课题基金(GREKF11-03). ; 中科院昆明动物所遗传资源与进化国家重点实验室开放课题基金(GREKF11-03). ; 中科院昆明动物所遗传资源与进化国家重点实验室开放课题基金(GREKF11-03). ; 中科院昆明动物所遗传资源与进化国家重点实验室开放课题基金(GREKF11-03). ; 中科院昆明动物所遗传资源与进化国家重点实验室开放课题基金(GREKF11-03). ; 中科院昆明动物所遗传资源与进化国家重点实验室开放课题基金(GREKF11-03). ; 中科院昆明动物所遗传资源与进化国家重点实验室开放课题基金(GREKF11-03). ; 中科院昆明动物所遗传资源与进化国家重点实验室开放课题基金(GREKF11-03). ; 中科院昆明动物所遗传资源与进化国家重点实验室开放课题基金(GREKF11-03). ; 中科院昆明动物所遗传资源与进化国家重点实验室开放课题基金(GREKF11-03). ; 中科院昆明动物所遗传资源与进化国家重点实验室开放课题基金(GREKF11-03). ; 中科院昆明动物所遗传资源与进化国家重点实验室开放课题基金(GREKF11-03). ; 中科院昆明动物所遗传资源与进化国家重点实验室开放课题基金(GREKF11-03). ; 中科院昆明动物所遗传资源与进化国家重点实验室开放课题基金(GREKF11-03). ; 中科院昆明动物所遗传资源与进化国家重点实验室开放课题基金(GREKF11-03). ; 中科院昆明动物所遗传资源与进化国家重点实验室开放课题基金(GREKF11-03). ; 中科院昆明动物所遗传资源与进化国家重点实验室开放课题基金(GREKF11-03). ; 中科院昆明动物所遗传资源与进化国家重点实验室开放课题基金(GREKF11-03). ; 中科院昆明动物所遗传资源与进化国家重点实验室开放课题基金(GREKF11-03). ; 中科院昆明动物所遗传资源与进化国家重点实验室开放课题基金(GREKF11-03). ; 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| 收录类别 | 其他 |
| 语种 | 中文 |
| 资助者 | 中科院昆明动物所遗传资源与进化国家重点实验室开放课题基金(GREKF11-03). ; 中科院昆明动物所遗传资源与进化国家重点实验室开放课题基金(GREKF11-03). ; 中科院昆明动物所遗传资源与进化国家重点实验室开放课题基金(GREKF11-03). ; 中科院昆明动物所遗传资源与进化国家重点实验室开放课题基金(GREKF11-03). ; 中科院昆明动物所遗传资源与进化国家重点实验室开放课题基金(GREKF11-03). ; 中科院昆明动物所遗传资源与进化国家重点实验室开放课题基金(GREKF11-03). ; 中科院昆明动物所遗传资源与进化国家重点实验室开放课题基金(GREKF11-03). ; 中科院昆明动物所遗传资源与进化国家重点实验室开放课题基金(GREKF11-03). ; 中科院昆明动物所遗传资源与进化国家重点实验室开放课题基金(GREKF11-03). ; 中科院昆明动物所遗传资源与进化国家重点实验室开放课题基金(GREKF11-03). ; 中科院昆明动物所遗传资源与进化国家重点实验室开放课题基金(GREKF11-03). ; 中科院昆明动物所遗传资源与进化国家重点实验室开放课题基金(GREKF11-03). ; 中科院昆明动物所遗传资源与进化国家重点实验室开放课题基金(GREKF11-03). ; 中科院昆明动物所遗传资源与进化国家重点实验室开放课题基金(GREKF11-03). ; 中科院昆明动物所遗传资源与进化国家重点实验室开放课题基金(GREKF11-03). ; 中科院昆明动物所遗传资源与进化国家重点实验室开放课题基金(GREKF11-03). ; 中科院昆明动物所遗传资源与进化国家重点实验室开放课题基金(GREKF11-03). ; 中科院昆明动物所遗传资源与进化国家重点实验室开放课题基金(GREKF11-03). ; 中科院昆明动物所遗传资源与进化国家重点实验室开放课题基金(GREKF11-03). ; 中科院昆明动物所遗传资源与进化国家重点实验室开放课题基金(GREKF11-03). ; 中科院昆明动物所遗传资源与进化国家重点实验室开放课题基金(GREKF11-03). ; 中科院昆明动物所遗传资源与进化国家重点实验室开放课题基金(GREKF11-03). ; 中科院昆明动物所遗传资源与进化国家重点实验室开放课题基金(GREKF11-03). ; 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| 文献类型 | 期刊论文 |
| 条目标识符 | http://ir.kiz.ac.cn/handle/152453/7480 |
| 专题 | 科研部门_兽类生态与进化（蒋学龙） 遗传资源与进化国家重点实验室 遗传资源与进化国家重点实验室_生命条形码中心 |
| 通讯作者 | Jiangxl@mail.kiz.ac.cn |
| 作者单位 | 1.中国科学院昆明动物研究所遗传资源与进化国家重点实验室,昆明650223 2.中国科学院大学,北京100049 3.莲花山国家级自然保护区管理局,甘肃康乐731516 4.中国科学院动物研究所动物进化与系统学重点实验室,北京100101 |
| 第一作者单位 | 昆明动物研究所 |
| 推荐引用方式 GB/T 7714 | 何锴,王文智,李权,等. DNA条形码技术在小型兽类物种鉴定中的探索:以甘肃莲花山为例[J]. 生物多样性,2013,21(2):197–205. |
| APA | 何锴.,王文智.,李权.,罗培鹏.,孙悦华.,...&Jiangxl@mail.kiz.ac.cn.(2013).DNA条形码技术在小型兽类物种鉴定中的探索:以甘肃莲花山为例.生物多样性,21(2),197–205. |
| MLA | 何锴,et al."DNA条形码技术在小型兽类物种鉴定中的探索:以甘肃莲花山为例".生物多样性 21.2(2013):197–205. |
| 条目包含的文件 | ||||||
| 文件名称/大小 | 文献类型 | 版本类型 | 开放类型 | 使用许可 | ||
| 2013061418.pdf（1053KB） | 期刊论文 | 出版稿 | 开放获取 | CC BY-NC-SA | 请求全文 | |
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