| 人类基因中同义密码子的偏好与密码子·反密码子间的结合强度密切相关吗? | |
| 石秀凡; 黄京飞; 梁宠荣; 柳树群; 谢君; 刘次全*; xfshi@263.net | |
| 2000 | |
| 发表期刊 | 科学通报
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| 卷号 | 45期号:23页码:2520-2525 |
| 合作性质 | 其它 |
| 摘要 | 分析了78个人类基因(19 967个密码子)中同义密码子的偏好使用情况, 计算了同义密码子的相对使用度和各种二核苷酸在密码子2,3位和3,4位的相对出现频率. 同时计算了密码子-反密码子碱基以Watson-Crick 配对时的堆积能. 结果显示人类基因对同义密码子的选择在所有密码子家族中都呈现明显一致的偏好：即偏好使用密码子-反密码子结合作用强的密码子, 恰好是以C结尾的密码子; 避免使用结合作用中度的密码子. 依据结果和数据分析, 推测人类基因对密码子的选择除了受基因组结构中isochore和genome signature 的影响外, 还和密码子-反密码子结合强度密切相关. 这些因素共同作用于人类基因, 从而在所有密码子家族中都呈现出对同义密码子明显一致的偏好现象. |
| 关键词 | 密码子偏好 同义密码子 人类基因 |
| 资助者 | 国家自然科学基金资助项目(批准号: 39970412);中国科学院"九五"重大项目子项目 ; 国家自然科学基金资助项目(批准号: 39970412);中国科学院"九五"重大项目子项目 ; 国家自然科学基金资助项目(批准号: 39970412);中国科学院"九五"重大项目子项目 ; 国家自然科学基金资助项目(批准号: 39970412);中国科学院"九五"重大项目子项目 ; 国家自然科学基金资助项目(批准号: 39970412);中国科学院"九五"重大项目子项目 ; 国家自然科学基金资助项目(批准号: 39970412);中国科学院"九五"重大项目子项目 ; 国家自然科学基金资助项目(批准号: 39970412);中国科学院"九五"重大项目子项目 ; 国家自然科学基金资助项目(批准号: 39970412);中国科学院"九五"重大项目子项目 ; 国家自然科学基金资助项目(批准号: 39970412);中国科学院"九五"重大项目子项目 ; 国家自然科学基金资助项目(批准号: 39970412);中国科学院"九五"重大项目子项目 ; 国家自然科学基金资助项目(批准号: 39970412);中国科学院"九五"重大项目子项目 ; 国家自然科学基金资助项目(批准号: 39970412);中国科学院"九五"重大项目子项目 ; 国家自然科学基金资助项目(批准号: 39970412);中国科学院"九五"重大项目子项目 ; 国家自然科学基金资助项目(批准号: 39970412);中国科学院"九五"重大项目子项目 ; 国家自然科学基金资助项目(批准号: 39970412);中国科学院"九五"重大项目子项目 ; 国家自然科学基金资助项目(批准号: 39970412);中国科学院"九五"重大项目子项目 ; 国家自然科学基金资助项目(批准号: 39970412);中国科学院"九五"重大项目子项目 ; 国家自然科学基金资助项目(批准号: 39970412);中国科学院"九五"重大项目子项目 ; 国家自然科学基金资助项目(批准号: 39970412);中国科学院"九五"重大项目子项目 ; 国家自然科学基金资助项目(批准号: 39970412);中国科学院"九五"重大项目子项目 ; 国家自然科学基金资助项目(批准号: 39970412);中国科学院"九五"重大项目子项目 ; 国家自然科学基金资助项目(批准号: 39970412);中国科学院"九五"重大项目子项目 ; 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| 收录类别 | 其他 |
| 语种 | 中文 |
| 资助者 | 国家自然科学基金资助项目(批准号: 39970412);中国科学院"九五"重大项目子项目 ; 国家自然科学基金资助项目(批准号: 39970412);中国科学院"九五"重大项目子项目 ; 国家自然科学基金资助项目(批准号: 39970412);中国科学院"九五"重大项目子项目 ; 国家自然科学基金资助项目(批准号: 39970412);中国科学院"九五"重大项目子项目 ; 国家自然科学基金资助项目(批准号: 39970412);中国科学院"九五"重大项目子项目 ; 国家自然科学基金资助项目(批准号: 39970412);中国科学院"九五"重大项目子项目 ; 国家自然科学基金资助项目(批准号: 39970412);中国科学院"九五"重大项目子项目 ; 国家自然科学基金资助项目(批准号: 39970412);中国科学院"九五"重大项目子项目 ; 国家自然科学基金资助项目(批准号: 39970412);中国科学院"九五"重大项目子项目 ; 国家自然科学基金资助项目(批准号: 39970412);中国科学院"九五"重大项目子项目 ; 国家自然科学基金资助项目(批准号: 39970412);中国科学院"九五"重大项目子项目 ; 国家自然科学基金资助项目(批准号: 39970412);中国科学院"九五"重大项目子项目 ; 国家自然科学基金资助项目(批准号: 39970412);中国科学院"九五"重大项目子项目 ; 国家自然科学基金资助项目(批准号: 39970412);中国科学院"九五"重大项目子项目 ; 国家自然科学基金资助项目(批准号: 39970412);中国科学院"九五"重大项目子项目 ; 国家自然科学基金资助项目(批准号: 39970412);中国科学院"九五"重大项目子项目 ; 国家自然科学基金资助项目(批准号: 39970412);中国科学院"九五"重大项目子项目 ; 国家自然科学基金资助项目(批准号: 39970412);中国科学院"九五"重大项目子项目 ; 国家自然科学基金资助项目(批准号: 39970412);中国科学院"九五"重大项目子项目 ; 国家自然科学基金资助项目(批准号: 39970412);中国科学院"九五"重大项目子项目 ; 国家自然科学基金资助项目(批准号: 39970412);中国科学院"九五"重大项目子项目 ; 国家自然科学基金资助项目(批准号: 39970412);中国科学院"九五"重大项目子项目 ; 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| 文献类型 | 期刊论文 |
| 条目标识符 | http://ir.kiz.ac.cn/handle/152453/7541 |
| 专题 | 结构生物信息学 细胞与分子进化开放实验室 |
| 通讯作者 | xfshi@263.net |
| 作者单位 | 中国科学院昆明动物研究所细胞与分子进化开放研究实验室,昆明650223 |
| 第一作者单位 | 昆明动物研究所 |
| 推荐引用方式 GB/T 7714 | 石秀凡,黄京飞,梁宠荣,等. 人类基因中同义密码子的偏好与密码子·反密码子间的结合强度密切相关吗?[J]. 科学通报,2000,45(23):2520-2525. |
| APA | 石秀凡.,黄京飞.,梁宠荣.,柳树群.,谢君.,...&xfshi@263.net.(2000).人类基因中同义密码子的偏好与密码子·反密码子间的结合强度密切相关吗?.科学通报,45(23),2520-2525. |
| MLA | 石秀凡,et al."人类基因中同义密码子的偏好与密码子·反密码子间的结合强度密切相关吗?".科学通报 45.23(2000):2520-2525. |
| 条目包含的文件 | ||||||
| 文件名称/大小 | 文献类型 | 版本类型 | 开放类型 | 使用许可 | ||
| 2013070302.pdf（358KB） | 期刊论文 | 出版稿 | 开放获取 | CC BY-NC-SA | 请求全文 | |
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